Este es un problema conocido que se manifiesta de vez en cuando; no significa que Google considere que Tor sea spyware.
Cuando usas Tor, estás enviando datos a través de repetidores de salida que son compartidos por miles de otros usuarios. Los usuarios de Tor ven este mensaje cuando otros usuarios de Tor envían consultas a Google durante un corto período de tiempo. Google interpreta el gran volumen de tráfico desde una sola dirección IP (el repetidor de salida que fue elegido) como alguien intentando "crawlear" su pagina, por lo que ralentizan el tráfico desde la dirección IP por un corto periodo.
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Una explicación alternativa es que Google intenta detectar ciertos tipos de spyware o virus que envían consultas parecidas a Google Search. Detecta la dirección IP de las consultas recibidas (sin tener en cuenta que es un repetidor de salida de Tor), e intenta alertar a las conexiones viniendo de esa dirección IP que las últimas consultas indican la presencia de un virus.
Según nuestra perspectiva, Google no está haciendo nada para obstaculizar específicamente el uso de Tor. El mensaje de error sobre ordenadores infectados desaparece por si mismo al cabo de un tiempo.